上海到喀什货运优化整合后，集装箱、邮政、行李包裹和行邮行包专列的铁路运费收入(含集装箱使用费)作为铁路局营业收入。总公司向铁路局收取铁路箱占用费，统一向集装箱公司付费。特货运输收入归属特货公司，并向提供服务的铁路局支付费用。

　　新成立的铁路总公司有三个专业运输公司，此次改革，铁路总公司对三个公司都进行优化调整。铁路总公司下发的《铁路货运组织改革指导意见》(下称“意见”)显示，业务方面，铁路总公司明确集装箱公司的运输业务回归铁路局，相关资产划归铁路局，集装箱公司不再经营铁路运输业务，上海到喀什货运专门负责铁路集装箱经营管理。

　　集装箱公司所属集装箱调度指挥权分别移交铁路总公司和铁路局，跨局集装箱调整由铁路总公司负责，局管内集装箱调整由铁路局负责。集装箱公司作为物流企业，可面向社会承揽集装箱货源，按托运人交铁路运输。国际集装箱联运业务仍由中铁集装箱公司所属中铁多联公司统一负责。

　过去铁路的运输效率低下一直为人诟病，这也是铁路货运量整体下降的一个很重要的原因，数据显示，今年1月铁路货运量3.44亿吨，同比增长1.6%。2月铁路货运量3.10亿吨，同比下降1.8%。自3月份开始，上海到喀什货运受宏观经济因素影响，铁路货源形势出现明显变化，各铁路局请求车、装车总量持续下降。

　　所以，此次货运改革，就显得尤为重要。4月12日下午，铁路总公司召开全路电视电话会议。盛光祖对进一步推进货运组织改革做出部署，动员全路各级组织和广大干部职工确保货运改革取得成功，推动铁路全方位走向市场。

　　5月20日至21日，盛光祖在全路货运改革工作会议上就全路货运组织改革提出了四点要求：“铁路货物运输要从以大宗货物为主的货物运输向全方位物流承运转变，铁路运输组织要由按计划组织运输的生产模式向与市场经济相适应的生产经营模式转变，干部职工要由坐等客户上门向主动服务、上门服务转变，工作方式方法要由传统习惯向提高效能的方向转变。”